Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NTRK3Q16288 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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