Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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