Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
R3HDM1Q15032 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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