Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TCIRG1Q13488 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TCIRG1Q13488 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TCIRG1Q13488 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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