Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GPS1Q13098 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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GPS1Q13098 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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