Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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