Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP160Q12769 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP160Q12769 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms