Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC15Q0P6D6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms