Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DDR1Q08345 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDR1Q08345 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms