Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSPL2Q05D32 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms