Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBE1Q04446 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms