Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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