Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
HBBP68871 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HBBP68871 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HBBP68871 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms