Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms