Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNAP25P60880 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.1 ms