Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BACE1P56817 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BACE1P56817 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms