Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB1P54762 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB1P54762 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms