Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms