Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ZNF391-201ENST00000244576 4079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 OR10G3-203ENST00000641185 2640 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ITGAX-203ENST00000562522 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AL359317.2-201ENST00000554898 1826 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PCP4P48539 MAGEC3-201ENST00000298296 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 NLRP12-203ENST00000391772 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 TRIM40-206ENST00000376724 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CLIP3-201ENST00000360535 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ZNF566-209ENST00000493391 3425 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ATP1A3-207ENST00000543770 3427 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CAPN9-203ENST00000366666 2173 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 OR10G3-202ENST00000641040 2533 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 LILRB1-204ENST00000396327 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 GRIK1-205ENST00000399909 3427 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ARHGAP30-202ENST00000368015 3887 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 OTOF-205ENST00000403946 6937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AL441943.2-201ENST00000421077 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 GRK1-201ENST00000335678 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PCP4P48539 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ANKRD26P1-201ENST00000566201 3921 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 LINC01391-203ENST00000495287 3538 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 AL117378.1-201ENST00000454596 2305 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 Z98259.3-202ENST00000641860 2210 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PCP4P48539 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms