Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GGCXP38435 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms