Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms