Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms