Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL9P32969 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL9P32969 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms