Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms