Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GCAP28676 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GCAP28676 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GCAP28676 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms