Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMBRP28336 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NMBRP28336 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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