Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2AP24928 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms