Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRGP23470 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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