Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRCP23327 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRCP23327 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRCP23327 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HRCP23327 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRCP23327 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms