Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL9A1P20849 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.8 ms