Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms