Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDCP19113 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDCP19113 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDCP19113 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms