Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOP08100 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOP08100 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms