Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA4P06727 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA4P06727 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA4P06727 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOA4P06727 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA4P06727 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA4P06727 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA4P06727 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA4P06727 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms