Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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