Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TULP3O75386 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TULP3O75386 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms