Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTSS1O43312 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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