Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRPO00591 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRPO00591 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRPO00591 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRPO00591 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRPO00591 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms