Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN25C9JDP6 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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