Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms