Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms