Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TNFSF18Q9UNG2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms