Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-18Q9QC07 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-18Q9QC07 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms