Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP35Q9P2H5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP35Q9P2H5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP35Q9P2H5 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP35Q9P2H5 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP35Q9P2H5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP35Q9P2H5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP35Q9P2H5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP35Q9P2H5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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