Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms