Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms