Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms