Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms