Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLVAPQ9BX97 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms