Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGMNQ99538 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms